木棉书院聚焦性别教育、家庭建设及特色课程建设等关键领域，积极组织教师开展课题申报工作。2024年共申报课题6项，2025年至今共申报了课题7项。课题内容紧密围绕学院特色课程发展方向，涵盖了特色课程实践研究探索、参与式教学的模式探索以及婚姻家庭等重要方向。通过深入的科研实践，不断深化性别教育与家庭教育课程的内涵，全方位提升课程质量与教学效果。这些科研成果为木棉书院科研水平的提升筑牢根基，也为特色课程建设注入强劲动力，为培养具有先进性别观念与良好家庭教育素养的优秀人才奠定坚实基础。